O novém předsedovi Fotbalové asociace České republiky však rozhodlo až druhé kolo tajné volby. Pro zvolení kandidáta v prvním kole by se totiž musela na novém předsedovi shodnout česká i moravská komora, a to se ve čtvrtek přítomným delegátům nepodařilo. Česká komora totiž v prvním kole odhlasovala poměrem 77:44 Karla Poborského, moravská zase poměrem 56:14 Petra Fouska.
Ve druhém kole už se počítaly hlasy obou komor dohromady a zvítězil v nich celkovým poměrem 106:89 Petr Fousek. Ten vyslovil ihned po zvolení přání, aby byli do výkonného výboru následně zvoleni konkrétní delegáti. „Chtěl bych požádat, aby byli na Moravě zvoleni pánové Šidliák, Nezval, Kristýn a Zima. Na české pozice potom Vladimír Šmicer a spolu s ním pánové Žďárský, Neumann, Řepka a Lípa,“ prohlásil Fousek.
To se mu však v plném rozsahu určitě nepovede. Moravským místopředsedou sice byl zvolen právník Jiří Šidliák, českým místopředsedou však navzdory přání Petra Fouska nebyl zvolen Vladimír Šmicer, ale poslanec z Hnutí ANO Jan Richter.